針對百日草連作情況也一定要注意土壤改良，百日草是非常忌連做的品種，連作主要表現為病原菌累積嚴重，尤其是土傳病害不斷發生，百日草苗期猝倒病、花期褐斑病，抗性低病蟲害發生頻繁，開花困難景觀差。目前花海百日草連作情況普遍，已成為景觀效果的主要威脅。針對這一情況可使用三滅4袋/畝+雨陽肥10-15kg/畝進行土壤處理。